战栗的龙卷藉著强大的超能力，将敌人的轰炸全都反弹回去。激战之后，原子武士等人发现强敌梅尔萨加德的弱点，地面上的情况渐渐地开著收尾。然而，当全世界屏气凝神抬头往上看着太空船时，在太空船内部，埼主正在跟黑暗盗贼团“黑暗物质”的头目波罗斯对峙。太过强大的波罗斯，为了寻求能与他势均力敌的对手，千里迢迢地来到地球。对面这个可以称得上是宿命对手的敌人，埼玉这次可以认真以待了吗？事关人类存亡的一场鏖战，终于燃起了战火。

战斗员梅尔萨加德，从飞到A市上空的巨大太空船当中，降落到地面，并一脚踢开了A级英雄居全铁。原子武士、金属球棒、银牙，与水嫩嫩囚犯等S级英雄前去应战，但梅尔萨加德的肉体，受到攻击也会立刻再长出来，无法对他造成致命的伤害，他们陷入了苦战。另一方面，埼玉一个人进入大太空船内部，横扫敌军破坏船舰内部，同时朝着中枢部位走过去。敌方干部格流刚许普，对埼玉的暴行感到愤怒，他为了扭转这个局面，决定再次轰炸地面。城市瞬间被毁，这种恶梦般的惨剧再度威胁着A市。

S级英雄们突然接到紧急召唤。埼玉与杰诺斯刚好前去拜托银牙的道馆，也跟银牙一同前去。来到位于A市的英雄协会总部，各个杰出的S级英雄都已经集结于会议室 。而在他们面前，英雄协会的干部开口了，说预言百分之百会命中的先知席芭芭瓦，在预言半年以内“地球有难了”之后，就过世了。正当会议室里的气氛紧张的时候，总部的大楼发出巨大声响并剧烈震动，四周被黑暗所包围。不久，切换到紧急电源之后，在会议室等待着他们的是，刚刚那一瞬间A市已近乎完全毁灭的这个事实。