故事发生在第一次地球联合战争爆发8年以后。随着越来越多的资深驾驶员在残酷的战斗中丧身，政府下令十几岁的少年也必须参军。在这样的时代背景下，年轻的联合军驾驶员工藤シン驾驶着爱机F-14出战。在一次战斗中，工藤不幸迫降在南海的一座孤岛上。但其实联合军和反联合军双方都探测到了岛上有异常能量反应，而主角却对此浑然不知......