幕末时期，地球人与外星人“天人”共处的大江户歌舞伎町，缺钱缴不出房租的万事屋三人组——银时（小栗旬饰）、新八（菅田将晖饰）、神乐（桥本环奈饰），接受了微笑酒店店长的委托，准备接待一位幕府中不得了的大人物。没想到，这位大人物竟然是征夷大将军德川茂茂（胜地凉饰）。另一方面，真选组鬼之副长土方十四郎（柳乐优弥饰）正被攘夷浪士们包围，就在他准备拔刀迎战的刹那，身体竟突然不听指使地向浪士们下跪求饶。原来土方出现了第二人格秋叶原宅男“阿年”，个性也变得懦弱害羞。而此时“真选组”爆发内斗，遭遇前所未有的存亡危机，将军也被迫卷入这场阴谋中，全江户开始动汤不安，万事屋与阿银也迎来最大的危机 。