影片故事讲述一所罗马尼亚研究所诞生的基因改造克隆人编号47的杀手故事。47的基因来自于世界上四大犯罪组织之首Lee Hong、Pablo Ochoa、Frantz Fuchs、Arkadij Jegorov以及其创造者科学家Otto Wolfgang Ort-Meyer。47儿时与其余约50名第四系列克隆人一同由研究所工作人员所抚养，接受枪械、搏击及刺杀训练，30岁时发现研究所的一个保安漏洞后逃脱，不久受雇于提供刺杀与佣兵服务的秘密组织国际契约情报局并迅速成为情报局内效能最高的杀手。