中央种子岛高中的“机器人研究部”面临着即将废社的危机。社内仅有的两名社员之一的八汐海翔在这样的情况下，依旧对机器人社提不起兴趣，整天猛玩机器人格斗游戏。而莽莽撞撞的无能社长－“濑乃宫秋穗”以完成“巨大机器人”为目标，为了避免被废社而奋斗着。

为了顺利取得经费，机器人部必须在ROBO-ONE大赛上取得优胜。峰回路转、紧张刺激的比赛后，机器人部顺利存活，还吸纳了在机械方面拥有极高天赋的日高昴入部。巨型机器人的建造有条不紊地进行着，而阴谋的黑影也悄悄笼罩种子岛。某日，海翔发现名为“君岛报告”的 A.R.标注。里面记载一位名为君岛晃的人物，揭发一项将世界卷入其中的巨大阴谋，这一切全与九年前的事件息息相关……

淳和及芙拉加入了机器人社。昴为了参加ROBO-ONE世界大赛调整M45、秋穂则是为了钢制作一号筹措资金，海翔调查君岛报告，大家各自过著忙碌的日子。某日，被家里禁止玩机器人的昴，在为M45进行基尔巴莱系统运用测试时被父亲宏武发现了。

世界变动率为“1.048596%”的2019年，这是个搭载了 Phondroid 作业系统，扩增实境“口袋电脑”普及的年代。在这样一个机器人已经普遍实用化的未来，种子岛（位于九州南部）中央高校的“机器人研究部”正面临废部危机，而仅有的两名部员之一——八汐海翔就算面临着这样的情况，仍旧对“机器人研究部”感到兴趣盎然，并且依旧热衷于机器人格斗游戏。而另一位一根筋的废材部长瀬乃宫秋穂为了避免被废部，正在以“完成巨型机器人”为目标奋斗着。然而某天，海翔发现了一份名为“君岛报告”的A.R.笔记。在这份笔记里面，记录着名为君岛安科的人将会把整个世界都卷进来的大阴谋。

海翔在宇宙之丘公园中看到、从口袋电脑一闪而逝的少女幽灵，在学校也有诸多传闻。海翔请对都市传说十分熟悉的淳和带他一起寻找岛上的传闻地点。夜里，海翔再度听到少女的声音，於是潜入已废弃的南种子岛乡土馆。在那里，他见到了透过「居尔夫。」的AR APP才能看到的少女「爱理」。

爱理，清秀的，梦幻的，有淑女气质的少女。平常显得非常有礼貌并且很天真，但有时会突然改变性格，变得面无表情，与君岛报告有着深刻关系的样子。

秋穗为了进行钢制造1号的计划，向JAXA种子岛宇宙中心要求协助却被拒绝。昴也分析钢制造1号的设计已经过时不能继续下去，然而秋穗还是坚持要完成。不顾努力奔走的秋穗，昴竟询问海翔是否有一起组队参加ROBO-ONE世界大赛的意愿。

神代芙拉，性格阴沉，口和性格都不好的家里蹲。不只是在网络上用死语，现实中也用，常用网络俚语。担当2000万人以上用户的机器人格斗游戏《GUNVARREL KILL BALLAD ON-LINE》的程序设计员。与海翔通过“KILL BALLAD”相识。与人的交流不感兴趣，除了在意的以外，他人的话完全听不下去。兴趣是妄想男性之间的恋爱，到处搜购以前的同人志时会一边发出“Duhuhu”的笑声，一边聚精会神地看。

爱理，清秀、虚幻而文静的美少女。平时用敬语很有礼貌，不过还显露出稚气未脱的天真，是个妹系角色。称呼"海翔"为“哥哥”并敬慕着，突然好像性格变了一样面无表情，谜团很多。似乎与君岛报告有着很深的关系。