1976年3月参加中国人民解放军第38军;
1979年8月任中央档案馆党史资料研究室干部;
1983年10月任国家经济委员会办公厅党组办公室干部(1984年7月至1987年7月在北京经济学院学习商业经济专业);
1988年5月任国家计划委员会经济研究中心经济师、副处长;
1991年11月任国家计划委员会办公厅委主任办公室副主任、委党组秘书;
1992年12月任国家计划委员会办公厅委主任办公室主任、委党组秘书(1995年9月至1998年7月在东北财经大学学习货币银行学专业);
1999年1月任国家发展计划委员会办公厅副主任;
2006年6月任国家发展和改革委员会离退休干部局局长;
2011年12月任国家发展和改革委员会办公厅主任;
2017年6月任国家发展和改革委员会副秘书长、办公厅主任。
2017年10月至2019年10月任国家发展和改革委员会副秘书长。[2-4]
2019年10月,国家发改委官方网站“委领导”栏目显示,周晓飞不再担任国家发展和改革委员会副秘书长。