学园都市拥有230万人口。立于其顶点的七名“超能力者（Level 5）”中的第1位·一方通行，与被称作“最后之作”的少女相遇。一方通行自贬为“恶”，却为从学园都市的黑暗中守护住这名少女，施展其最强最恶的能力。