《康熙微服私访记3》主要描述了康熙年间黄河连年泛滥,沿岸百姓苦不堪言,康熙皇帝体恤民情励志治河,亲自九下江南巡视黄河灾情,更由此引出了一幕幕传颂一时的传奇故事。该剧分为《锦袍记》《食盒记》《铃铛记》三个故事。该剧保持了第一、二部有别于港台古装戏的“新派历史剧”风格,强调以史为镜、观照现实,但节奏将更加紧凑、剧情更加曲折浓烈。